xcms

LC / MS与GC / MS数据分析

Bioconductor版本:2.6

框架处理和可视化的色谱分离和single-spectra质量的光谱数据。从友邦保险/进口安迪NetCDF、mzXML mzData文件。高通量的预处理数据,没有针对性分析物分析。

作者:科林·a·史密斯在scripps.edu < csmith >,拉尔夫Tautenhahn < rtautenh scripps.edu >,史蒂芬诺伊曼< sneumann在ipb-halle.de >

维护人员:科林·a·史密斯在scripps.edu < csmith >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“xcms”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“xcms”)

文档

PDF		FlowChart.pdf
PDF	R脚本	分组与xcms FTICR-MS数据
PDF	R脚本	安装说明xcms
PDF	R脚本	LC / MS与xcms预处理和分析
PDF	R脚本	处理串联和女士与xcms ^ n数据与美元
PDF		参考手册

细节

biocViews	技术,MassSpectrometry
取决于	R(> = 1.9.0)方法
进口
建议	faahKO,msdata,乘,ncdf,rgl,MassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANN,雪
系统需求	NetCDF, zlib
许可证	GPL (> = 2)
URL	http://metlin.scripps.edu/download/
取决于我	相机,TargetSearch
进口我	相机,flagme
建议我	faahKO,MassSpecWavelet,msdata
版本	1.22.1
自	Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早

包下载

包的来源	xcms_1.22.1.tar.gz
Windows二进制	xcms_1.22.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	xcms_1.22.1.tgz
包下载报告	下载数据