topGO

topGO:基因本体的富集分析

Bioconductor版本:2.6

topGO包提供了测试GO术语的工具，同时考虑GO图的拓扑结构。可以实现和应用不同的测试统计数据和消除GO术语之间的局部相似性和依赖性的不同方法。

作者:Adrian Alexa, Jorg Rahnenfuhrer

维护者:Adrian Alexa < Alexa at mpi-inf.mpg.de>

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“topGO”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“topGO”)

文档

PDF	R脚本	topGO
PDF		topGO_classes_v3.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，生物信息学，可视化
取决于	R(>= 2.10.0)，方法，图(> = 1.14.0),Biobase(> = 2.0.0),GO.db(> = tripwire),AnnotationDbi(> = 1.7.19),SparseM(> = 0.73)
进口	方法,图，Biobase，SparseM，AnnotationDbi，晶格
建议	所有，hgu95av2.db，hgu133a.db，genefilter，xtable，乘，Rgraphviz，globaltest
系统需求
许可证	LGPL
URL
全靠我	RNAither
进口我
建议我	林格
版本	1.16.2
自	Bioconductor 2.0 (R-2.5)

包下载

包的来源	topGO_1.16.2.tar.gz
Windows二进制	topGO_1.16.2.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	topGO_1.16.2.tgz
软件包下载报告	下载数据