qpgraph

逆向工程与qp-graphs的分子调控网络

Bioconductor版本:2.6

q-order偏相关图,简称qp-graphs,无向高斯图形马尔科夫模型由q-order部分相关性。他们是很有用的学习无向图形化高斯马尔可夫模型从数据集随机变量p的数量超过了可用的样本大小为n,例如,在微阵列数据的情况下,他们可以用来进行反向工程,生成分子调控网络。

作者:r . Castelo和a . Roverato

维护人员:罗伯特Castelo <罗伯特。在upf.edu castelo >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qpgraph”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“qpgraph”)

PDF		qpPCCdistbyTF.pdf
PDF		qpPreRecComparison.pdf
PDF		qpPreRecComparisonFullRecall.pdf
PDF		qpTRnet50pctpre.pdf
PDF	R脚本	逆向工程使用qpgraph转录调控网络
PDF		参考手册

biocViews	微阵列,GeneExpression,转录,通路,生物信息学,GraphsAndNetworks
取决于	方法,Biobase(> = 2.5.5),AnnotationDbi
进口	方法,Biobase(> = 2.5.5),AnnotationDbi
建议	mvtnorm,图,Rgraphviz,注释,genefilter,类别(> = 2.9.7),org.EcK12.eg.db(> = 2.2.6款),GOstats
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL	http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph
取决于我
进口我
建议我
版本	1.4.1
自	Bioconductor 2.4 (r - 2.9)