生物导体版本:2.6
对Affymetrix Genechip数据的大多数分析都是基于表达水平的点估计值,而忽略了此类估计值的不确定性。通过传播对下游分析的不确定性,我们可以通过微阵列分析改善结果。PUMA软件包首次制造了一套不确定性传播方法,可供普通受众使用。PUMA还提供了与以前可用的不确定性传播方法相比的范围和执行速度的改进。其中包括摘要,差异表达检测,聚类和PCA方法,以及有用的绘图和数据操作函数。
作者:理查德·皮尔森(Richard D.
维护者:理查德·皮尔森
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参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,生物信息学,,,,差异性,,,,聚类 |
要看 | r(> = 2.6.0),生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4),图形,grdevices,方法,统计,utils,mclust |
进口 | 生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4) |
建议 | Pumadata,,,,Affydata,,,,雪,,,,林玛,,,,注释,,,,rocr |
系统要求 | |
执照 | LGPL |
URL | http://umber.sbs.man.ac.uk/resources/puma |
取决于我 | Pumadata |
进口我 | 蒂格 |
建议我 | 蒂格 |
版本 | 2.0.0 |
自从 | 生物导体2.0(R-2.5) |
包源 | puma_2.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | puma_2.0.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | puma_2.0.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载统计 |