彪马

在微阵列分析中传播不确定性

生物导体版本:2.6

对Affymetrix Genechip数据的大多数分析都是基于表达水平的点估计值,而忽略了此类估计值的不确定性。通过传播对下游分析的不确定性,我们可以通过微阵列分析改善结果。PUMA软件包首次制造了一套不确定性传播方法,可供普通受众使用。PUMA还提供了与以前可用的不确定性传播方法相比的范围和执行速度的改进。其中包括摘要,差异表达检测,聚类和PCA方法,以及有用的绘图和数据操作函数。

作者:理查德·皮尔森(Richard D.

维护者:理查德·皮尔森

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来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ puma”)

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引用(“ puma”)

文档

PDF PUMA-014.pdf
PDF PUMA-015.pdf
PDF puma-016.pdf
PDF puma-022.pdf
PDF puma-023.pdf
PDF puma-024.pdf
PDF puma.pdf
PDF rplots.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,生物信息学,,,,差异性,,,,聚类
要看 r(> = 2.6.0),生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4),图形,grdevices,方法,统计,utils,mclust
进口 生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4)
建议 Pumadata,,,,Affydata,,,,,,,,林玛,,,,注释,,,,rocr
系统要求
执照 LGPL
URL http://umber.sbs.man.ac.uk/resources/puma
取决于我 Pumadata
进口我 蒂格
建议我 蒂格
版本 2.0.0
自从 生物导体2.0(R-2.5)

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包源 puma_2.0.0.tar.gz
Windows二进制 puma_2.0.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 puma_2.0.0.tgz
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