NEM
嵌套效应模型以重建表型层次结构
生物导体版本：2.6
软件包“ NEM”允许从扰动效应的嵌套结构中重建路径的特征。它作为输入（1.）一组受扰动的途径成分，以及（2）。输出是代表表型层次结构的有向图。
作者：Holger Froehlich，Florian Markowetz，Achim Tresch，Christian Bender，Matthias Maneck，Claudio Lottaz，Tim Beissbarth
维护者：Christian Bender
要安装此软件包，请启动R并输入：
来源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ nem”）
要在出版物中引用此软件包，请启动R并输入：
引用（“ NEM”）
文档
| Markowetz-assis-2006.pdf | ||
| R脚本 | 嵌套效应模型 - 果蝇免疫反应的一个例子 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，生物信息学，，，，GraphSandNetworks，，，，途径 |
| 要看 | r（> = 2.0），E1071（> = 1.5），图形（> = 1.24），rgraphviz（> = 1.22），plotrix，，，，林玛，时间（> = 1.0），簇（> = 1.11） |
| 进口 | 引导，，，，E1071，，，，图形，图形，grdevices，方法，rbgl（> = 1.8.1），rcolorbrewer，，，，rgraphviz，统计，utils |
| 建议 | 生物酶（> = 1.10） |
| 系统要求 | |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| URL | //www.anjoumacpherson.com |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 版本 | 2.12.0 |
| 自从 | 生物导体1.9（R-2.4） |
软件包下载
| 包源 | nem_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | nem_2.12.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.5（豹）二进制 | nem_2.12.0.tgz |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
