Bioconductor版本:2.6
基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时,用户也可以选择一个可能更快的零分布,它是均值为零的多元正态分布,方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。
作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit
维护者:Katherine S. Pollard
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参考手册 |
biocViews | 微阵列,DifferentialExpression,MultipleComparisons |
取决于 | R(>= 2.9.0),方法,Biobase |
进口 | 生存,质量 |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | LGPL |
URL | |
全靠我 | ABarray,aCGH,BicARE,ChIPpeakAnno,GGtools,KCsmart,LMGene,OCplus,SAGx,siggenes,webbioc |
进口我 | aCGH,adSplit,ChIPpeakAnno,globaltest,snapCGH |
建议我 | annaffy,BiocCaseStudies,ecolitk,GeneSelector,GOstats,GSEAlm,maigesPack,oneChannelGUI,pcot2,安全,SSPA,topGO,xcms |
版本 | 测试盒框 |
自 | Bioconductor 1.6 (R-2.1)或更早的版本 |
包的来源 | multtest_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | multtest_2.4.0.zip(32位和64位) |
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 | multtest_2.4.0.tgz |
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