基于重采样的多重假设检验

Bioconductor版本:2.6

基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时,用户也可以选择一个可能更快的零分布,它是均值为零的多元正态分布,方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。

作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit

维护者:Katherine S. Pollard

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细节

biocViews 微阵列DifferentialExpressionMultipleComparisons
取决于 R(>= 2.9.0),方法,Biobase
进口 生存质量
建议
系统需求
许可证 LGPL
URL
全靠我 ABarrayaCGHBicAREChIPpeakAnnoGGtoolsKCsmartLMGeneOCplusSAGxsiggeneswebbioc
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