MADB

微阵列数据库和实用程序功能用于微阵列数据分析。

生物导体版本:2.6

MADB允许创建一个简单的微阵列数据库,以将微阵列实验和注释数据存储在其中。Affymetrix Genechip表达值以及来自两个颜色微阵列的值可以存储到数据库中。可以将整个实验或从微阵列子集中的基因子集的值(或一个子集的值)获取的整个实验或子集。还可以将MADB提供给R。数据点根据局部点密度或函数编码的颜色颜色,该函数允许重复处理米罗阵列。

作者:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)

维护者:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)

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PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,两通道,,,,Onechannel,,,,可视化
要看 r(> = 2.6.0),生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4),pgutils(> = 1.5.0),林玛(> = 1.8.0),方法
进口
建议 安菲(> = 1.6.2),Biomart(> = 1.8.2),Geneplotter
系统要求
执照 LGPL(> = 2)
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自从 生物导体1.6(R-2.1)或更早

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