Lumi

Beadarray微型阵列的特定方法

生物导体版本:2.6

Lumi软件包为Illumina微阵列数据分析提供了集成解决方案。它包括Illumina beadstudio数据输入,质量控制,贝达array特异性方差稳定,归一化和基因注释在探针水平上的功能。

作者:潘·杜(Pan du),帮派冯,沃伦·基布(Warren Kibbe),西蒙·林(Simon Lin)

维护者:pan du

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来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ Lumi”)

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引用(“ Lumi”)

文档

PDF bioc2007_lumi_presentation.pdf
PDF R脚本 Lumi
PDF R脚本 Lumi
PDF R脚本 Lumi
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理
要看 r(> = 2.4.0),注释,,,,副词(> = 1.23.4),生物酶(> = 2.5.5),MGCV(> = 1.4-0),方法,预处理,,,,rsqlite,,,,大量的
进口
建议 Beadarray,,,,林玛,,,,VSN,,,,Lumibarnes,,,,Lumihumanall.db,,,,Lumhumanidmapping,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer
系统要求
执照 LGPL(> = 2)
URL
取决于我 arraymvout,,,,Lumibarnes,,,,Lumhumanidmapping,,,,LumimouseIdMapping,,,,LumiratidMapping,,,,maqcsubset,,,,maqcsubsetilm,,,,mvoutdata
进口我
建议我 Beadarray
版本 1.14.0
自从 生物导体2.0(R-2.5)

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包源 Lumi_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 lumi_1.14.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 Lumi_1.14.0.tgz
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