limma

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:2.6

数据分析,微阵列数据的线性模型和微分表达式。

作者:戈登·史密斯与马修·里奇贡献杰里米银、詹姆斯•Wettenhall娜塔莉·索恩,Mette Langaas,埃吉尔Ferkingstad,马库斯戴维,弗朗索瓦•Pepin Dongseok崔Di,艾丽西亚Oshlack,卡罗琳格拉夫,易纺,魏史和贝琳达Phipson。

维护人员:戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“limma”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“limma”)

biocViews	微阵列,OneChannel,TwoChannel,DataImport,质量控制,预处理,生物信息学,DifferentialExpression,MultipleComparisons,TimeCourse
取决于	R (> = tripwire)方法
进口
建议	affy,marray,质量,org.Hs.eg.db样条函数,statmod(> = 1.2.2),vsn
系统需求
许可证	LGPL
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/limma
取决于我	AffyExpress,affylmGUI,Agi4x44PreProcess,AgiMicroRna,CALIB,亚兰,cghMCR,ChIPpeakAnno,clippda,codelink,转换,HTqPCR,iChip,limmaGUI,时间的,maigesPack,marray,nem,oneChannelGUI,qpcrNorm,林格,RMAGEML,RTools4TB,snapCGH,timecourse
进口我	affycoretools,ArrayExpress,arrayQuality,arrayQualityMetrics,ArrayTools,beadarray,betr,ChIPpeakAnno,刨边机,explorase,HTqPCR,maSigPro,林格,RNAither,snapCGH,SSPA,vsn
建议我	ABarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,类别,CMA,dyebias,GeneSelector,GEOquery,光民,methylumi,益生元,奥林,plw,彪马,rtracklayer
版本	3.4.5
自	Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早