globaltest

协变量的测试组/特性与响应变量,应用基因测试

Bioconductor版本:2.6

全球协变量的测试测试组(或特性)与响应变量。这个包实现了测试与诊断的情节和多个测试工具,连同几个函数方便使用这个测试基因集的测试和KEGG术语。

作者:Jelle Goeman < j。在lumc.nl goeman >and Jan Oosting

维护人员:Jelle Goeman < j。在lumc.nl goeman >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“globaltest”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“globaltest”)

文档

PDF	R脚本	全球测试
PDF	R脚本	全球测试(弃用版本4)
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,生物信息学,DifferentialExpression,去,通路
取决于	方法
进口	Biobase(> = 2.5.5),生存,AnnotationDbi,注释,乘、图形
建议	vsn,golubEsets,KEGG.db,hu6800.db,Rgraphviz,GO.db,lungExpression,org.Hs.eg.db,注释,Biobase(> = 2.5.5),生存,GSEABase
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL	http://www.msbi.nl/goeman
取决于我	GlobalAncova
进口我	SIM卡
建议我	topGO
版本	5.2.0
自	Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早

包下载

包的来源	globaltest_5.2.0.tar.gz
Windows二进制	globaltest_5.2.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	globaltest_5.2.0.tgz
包下载报告	下载数据