生物导体版本:2.6
该软件包实施了一系列基于家庭的基于家庭的关联测试,并使用“ FBAT”软件程序中的代码进行调整(请参阅http://www.biostat.harvard.edu/~fbat/~fbat/fbat.htm)。功能包括: - 使用来自核家庭,sibships,血统或任何组合的数据;提供有或没有创始人基因型的无偏测试。- 分析二分法,测量或发表时间性状和多个特征;特质定义可以优化。- 使用标准遗传模型(添加剂,显性,隐性或基因型)提供双行和多平行性结合测试。- 提供了零假设的大型样本和蒙特卡洛精确检验:没有联系,没有关联;提供H0的大型样本测试:无关联。- 估计等位基因频率;检查门德尔的一致性。 - Tests multiple markers using haplotypes; estimates haplotype frequencies and linkage disequilibrium between pairs of markers. - Offers two multi-marker tests for testing multiple markers simultaneously, without resolving phase or assuming no recombination. - Uses standard pedigree data files; phenotype file is optional. - Offers the Sibs Disequilibrium Test.
作者:weiliang qiu
维护者:r遗传学项目
要安装此软件包,请启动R并输入:
来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ fbat”)
要在出版物中引用此软件包,请启动R并输入:
引用(“ FBAT”)
R脚本 | 使用\ rpackage {fbat | |
参考手册 |
生物浏览 | 遗传学 |
要看 | 遗传基础 |
进口 | 遗传基础,,,,大量的,统计,utils |
建议 | |
系统要求 | |
执照 | LGPL |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 遗传基础 |
版本 | 1.12.0 |
自从 | 生物导体2.0(R-2.5) |
包源 | fbat_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | fbat_1.12.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | fbat_1.12.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载统计 |