FBAT

基于家庭的关联测试遗传数据。

生物导体版本:2.6

该软件包实施了一系列基于家庭的基于家庭的关联测试,并使用“ FBAT”软件程序中的代码进行调整(请参阅http://www.biostat.harvard.edu/~fbat/~fbat/fbat.htm)。功能包括: - 使用来自核家庭,sibships,血统或任何组合的数据;提供有或没有创始人基因型的无偏测试。- 分析二分法,测量或发表时间性状和多个特征;特质定义可以优化。- 使用标准遗传模型(添加剂,显性,隐性或基因型)提供双行和多平行性结合测试。- 提供了零假设的大型样本和蒙特卡洛精确检验:没有联系,没有关联;提供H0的大型样本测试:无关联。- 估计等位基因频率;检查门德尔的一致性。 - Tests multiple markers using haplotypes; estimates haplotype frequencies and linkage disequilibrium between pairs of markers. - Offers two multi-marker tests for testing multiple markers simultaneously, without resolving phase or assuming no recombination. - Uses standard pedigree data files; phenotype file is optional. - Offers the Sibs Disequilibrium Test.

作者:weiliang qiu ross lazarus gregory> gregory warnes nitin jain jain jain

维护者:r遗传学项目

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版本 1.12.0
自从 生物导体2.0(R-2.5)

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