arrayQualityMetrics

质量标准在微阵列数据集

Bioconductor版本:2.6

这个包生成一个质量量度报告ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch或BeadLevelList对象包含微阵列数据与一个或两个渠道。

作者:沃尔夫冈·胡贝尔奥黛丽•考夫曼

维修工:奥黛丽考夫曼<考夫曼在bergonie.org >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“arrayQualityMetrics”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“arrayQualityMetrics”)

文档

PDF	R脚本	arrayQualityMetrics模块
PDF	R脚本	质量评估与arrayQualityMetrics
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,质量控制,OneChannel,TwoChannel,ReportWriting
取决于	affyPLM
进口	Biobase,RColorBrewer,affy,beadarray,genefiltergrDevices图形,hwriter,晶格,latticeExtra,limma,marray、方法、simpleaffy、统计、stats4跑龙套,vsn
建议	ALLMLL,亚兰
系统需求
许可证	LGPL (> = 2)
URL
取决于我
进口我
建议我
版本	2.6.0
自	Bioconductor 2.1 (r - 2.6)

包下载

包的来源	arrayQualityMetrics_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_2.6.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	arrayQualityMetrics_2.6.0.tgz
包下载报告	下载数据