注释

微阵列注释

Bioconductor版本:2.6

使用R环境进行注释。

作者:R. Gentleman

维护者:Biocore Team c/o BioC用户列表

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“注释”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“注释”)

文档

PDF	R脚本	注释的概述
PDF	R脚本	GO基本用法
PDF	R脚本	获得HTML输出
PDF	R脚本	方法:利用染色体信息
PDF	R脚本	如何使用在线查询工具
PDF	R脚本	使用Affymetrix探测级别数据
PDF	R脚本	使用数据包
PDF	R脚本	使用同源包
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，通路，去，Affymetrix
取决于	R (>= 2.4.0)，AnnotationDbi(> = 0.1.15)
进口	Biobase，AnnotationDbi，xtable，图形，utils，统计，方法
建议	Biobase，hgu95av2.db，genefilter，Biostrings(> = 2.4.4),rae230a.db，rae230aprobe，tkWidgets，XML(> = 0.92 2),GO.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，hom.Hs.inp.db
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
全靠我	Agi4x44PreProcess，ChromHeatMap，GeneAnswers，geneplotter，GGtools，GSEABase，染色体组型，光民，macat，MLInterfaces，Neve2006，ontoTools，PCpheno，RpsiXML，安全，ScISI
进口我	affycoretools，类别，ChromHeatMap，codelink，genefilter，geneplotter，GlobalAncova，globaltest，GOstats，GSEABase，安全，ScISI，splicegear
建议我	adme16cod.db，ag.db，ath1121501.db，BiocCaseStudies，biomaRt，bovine.db，canine.db，canine2.db，celegans.db，chicken.db，drosgenome1.db，drosophila2.db，geneplotter，GGHumanMethCancerPanelv1.db，GlobalAncova，globaltest，GOstats，GSEAlm，h10kcod.db，h20kcod.db，hcg110.db，hgfocus.db，hgu133a.db，hgu133a2.db，hgu133b.db，hgu133plus2.db，hgu95a.db，hgu95av2.db，hgu95b.db，hgu95c.db，hgu95d.db，hgu95e.db，hguatlas13k.db，hgubeta7.db，hguDKFZ31.db，hgug4100a.db，hgug4101a.db，hgug4110b.db，hgug4111a.db，hgug4112a.db，hguqiagenv3.db，hi16cod.db，hs25kresogen.db，Hs6UG171.db，hthgu133a.db，hthgu133b.db，hu35ksuba.db，hu35ksubb.db，hu35ksubc.db，hu35ksubd.db，hu6800.db，hugene10stprobeset.db，hugene10sttranscriptcluster.db，hugene11stprobeset.db，hugene11sttranscriptcluster.db，HuO22.db，hwgcod.db，illuminaHumanDASLBeadID.db，IlluminaHumanMethylation27k.db，illuminaHumanv1.db，illuminaHumanv1BeadID.db，illuminaHumanv2.db，illuminaHumanv2BeadID.db，illuminaHumanv3.db，illuminaHumanv3BeadID.db，illuminaMousev1.db，illuminaMousev1BeadID.db，illuminaMousev1p1.db，illuminaMousev1p1BeadID.db，illuminaMousev2.db，illuminaMousev2BeadID.db，illuminaRatv1.db，illuminaRatv1BeadID.db，indac.db，JazaeriMetaData.db，LAPOINTE.db，lumiHumanAll.db，lumiMouseAll.db，lumiRatAll.db，m10kcod.db，m20kcod.db，maigesPack，mgu74a.db，mgu74av2.db，mgu74b.db，mgu74bv2.db，mgu74c.db，mgu74cv2.db，mguatlas5k.db，mgug4104a.db，mgug4120a.db，mgug4121a.db，mgug4122a.db，mi16cod.db，mm24kresogen.db，moe430a.db，moe430b.db，mogene10stprobeset.db，mogene10sttranscriptcluster.db，mogene11stprobeset.db，mogene11sttranscriptcluster.db，mouse4302.db，mouse430a2.db，mpedbarray.db，mu11ksuba.db，mu11ksubb.db，Mu15v1.db，mu19ksuba.db，mu19ksubb.db，mu19ksubc.db，Mu22v3.db，mwgcod.db，Norway981.db，nugohs1a520180.db，nugomm1a520177.db，oneChannelGUI，OperonHumanV3.db，org.Ag.eg.db，org.At.tair.db，org.Bt.eg.db，org.Ce.eg.db，org.Cf.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.EcK12.eg.db，org.EcSakai.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Mmu.eg.db，org.Pf.plasmo.db，org.Pt.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Sc.sgd.db，org.Sco.eg.db，org.Ss.eg.db，org.Xl.eg.db，PartheenMetaData.db，pedbarrayv10.db，pedbarrayv9.db，POCRCannotation.db，彪马，qpgraph，r10kcod.db，rae230a.db，rae230b.db，ragene10stprobeset.db，ragene10sttranscriptcluster.db，ragene11stprobeset.db，ragene11sttranscriptcluster.db，rat2302.db，rgu34a.db，rgu34b.db，rgu34c.db，rguatlas4k.db，rgug4105a.db，rgug4130a.db，rgug4131a.db，ri16cod.db，rnu34.db，Roberts2005Annotation.db，rtu34.db，rwgcod.db，SHDZ.db，siggenes，tigre，u133x3p.db，xlaevis.db，yeast2.db，ygs98.db，zebrafish.db
版本	1.26.1
自	Bioconductor 1.6 (R-2.1)或更早的版本

包下载

包的来源	annotate_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	annotate_1.26.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	annotate_1.26.1.tgz
软件包下载报告	下载数据