affyPLM

探针级模型的拟合方法

Bioconductor版本:2.6

扩展和改进基本affy包功能的包。为了提高速度而大量使用已编译代码的例程。重点是实现用于拟合探针级模型的方法和使用这些模型的工具。基于PLM的质量评估工具。

作者:Ben Bolstad

维护者:Ben Bolstad

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyPLM”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“affyPLM”)

文档

PDF	R脚本	affyPLM: mapplot函数的高级使用
PDF	R脚本	affyPLM:拟合探针水平模型
PDF	R脚本	affyPLM: Affymetrix基因芯片基于模型的质量控制评估
PDF	R脚本	affyPLM:三步函数
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，质量控制
取决于	R (>= 2.6.0)，affy(> = 1.11.0),Biobase、方法、gcrma统计数据,preprocessCore(> = 1.5.1)
进口
建议	affydata
系统需求
许可证	GPL (>= 2)
URL	http://bmbolstad.com
全靠我	affyQCReport，arrayQualityMetrics，frmaTools，RefPlus
进口我
建议我	AffyExpress，affylmGUI，arrayMvout，ArrayTools，BiocCaseStudies，frmaTools，metahdep，oneChannelGUI
版本	1.24.1
自	Bioconductor 1.6 (R-2.1)或更早的版本

包下载

包的来源	affyPLM_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	affyPLM_1.24.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	affyPLM_1.24.1.tgz
软件包下载报告	下载数据