adSplit

注解驱动的集群

Bioconductor版本:2.6

这个方案实现了微阵列基因表达谱聚类根据功能注释。对于每个术语基因注释,分裂成两个子类是计算和一组支持基因的重要性决定。

作者:克劳迪奥·Lottaz Joern Toedling

维修工:克劳迪奥Lottaz <克劳迪奥。在klinik.uni-regensburg.de Lottaz >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“adSplit”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“adSplit”)

文档

PDF	R脚本	注解驱动的集群
PDF		bcb_logo.pdf
PDF		minerva_bcb.pdf
PDF		Rplots.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,生物信息学,聚类
取决于	R(> =魅惑)、方法(> = 2.1.0的)
进口	AnnotationDbi,Biobase(> = 1.5.12),集群(> = 1.9.1),GO.db(> = 1.8.1)、图形、grDevicesKEGG.db(> = 1.8.1)、方法乘(> = 1.6.0),数据(> = 2.1.0的)
建议	golubEsets(> = 1.0),vsn(> = 1.5.0),hu6800.db(> = 1.8.1)
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL	http://compdiag.molgen.mpg.de/software/index.shtml
取决于我
进口我
建议我
版本	1.18.0
自	Bioconductor 1.8 (r - 2.3)

包下载

包的来源	adSplit_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	adSplit_1.18.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	adSplit_1.18.0.tgz
包下载报告	下载数据