RpsiXML

R接口到PSI-MI 2.5文件

Bioconductor版本:2.6

查询、数据结构和交互数据集可视化的接口。这个包实现了PSI-MI 2.5标准,目前支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断增加。

作者:Jitao David Zhang, Stefan Wiemann, Marc Carlson, Tony Chiang撰稿

维护者:Jitao David Zhang

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)

要在出版物中引用此包,请输入R并输入:

引用(“RpsiXML”)

文档

PDF R脚本 RpsiXML包的应用实例
PDF R脚本 读取PSI-25 XML文件
PDF 参考手册

细节

biocViews 基础设施蛋白质组学
取决于 方法,注释(> = 1.21.0),(> = 1.21.0),BiobaseRBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
建议 org.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Dm.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Sc.sgd.dbhom.Hs.inp.dbhom.Mm.inp.dbhom.Dm.inp.dbhom.Rn.inp.dbhom.Sc.inp.dbRgraphvizppiStats
系统需求
许可证 LGPL-3
URL //www.anjoumacpherson.com
全靠我 ScISI
进口我 ScISI
建议我
版本 1.8.0
Bioconductor 2.3 (R-2.8)

包下载

包的来源 RpsiXML_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 RpsiXML_1.8.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 RpsiXML_1.8.0.tgz
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