IRanges
基础设施用于操作间隔序列
Bioconductor版本:2.6
包提供了高效的底层和高度可重用的S4类存储范围的整数,RLE向量(行程长度编码),而且,更普遍的是,可以按顺序组织数据,以及对这些序列的看法。有效的类似类也提供了用于存储大的基本类的实例的集合。包中所有的类使用一致的命名和共享相同的富人和“序列API”尽可能一致。
作者:h .页,p . Aboyoun和m .劳伦斯
维护人员:Biocore团队c / o BioC用户列表< bioconductor在stat.math.ethz.ch >
安装这个包,开始R和输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“IRanges”)
在出版物引用这个包,开始R和输入:
引用(“IRanges”)
文档
细节
| biocViews |
基础设施,遗传学 |
| 取决于 |
R(> = 2.8.0)、方法、效用,统计数据 |
| 进口 |
方法,跑龙套,统计数据 |
| 建议 |
RUnit |
| 系统需求 |
|
| 许可证 |
艺术- 2.0 |
| URL |
|
| 取决于我 |
BayesPeak,biocDatasets,Biostrings,BSgenome,ChIPpeakAnno,chipseq,GenomicFeatures,GenomicRanges,Genominator,GGtools,girafe,harbChIP,Masks.Dmelanogaster.UCSC.dm3,oneChannelGUI,图片,rGADEM,rMAT,Rsamtools,ShortRead,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427,VanillaICE,xmapcore |
| 进口我 |
BayesPeak,biocDatasets,Biostrings,魅力,ChIPpeakAnno,chipseq,ChIPseqR,ChIPsim,ChromHeatMap,GenomicFeatures,GenomicFeatures,GenomicRanges,GGtools,Masks.Dmelanogaster.UCSC.dm3,methVisual,MotIV,pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1,pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter,pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter,pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter,pd.charm.hg18.example,pd.cytogenetics.array,pd.feinberg.hg18.me.hx1,pd.feinberg.mm8.me.hx1,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6,pd.hg.u95a,pd.hg.u95av2,pd.ht.hg.u133.plus.pm,pd.huex.1.0.st.v2,pd.hugene.1.0.st.v1,pd.hugene.1.1.st.v1,pd.mapping250k.nsp,pd.mapping250k.sty,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping50k.xba240,pd.moex.1.0.st.v1,pd.mogene.1.0.st.v1,pd.mogene.1.1.st.v1,pd.mouse430.2,pd.raex.1.0.st.v1,pd.ragene.1.0.st.v1,pd.ragene.1.1.st.v1,pdInfoBuilder,图片,rGADEM,rMAT,Rolexa,Rsamtools,rtracklayer,segmentSeq,ShortRead,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427 |
| 建议我 |
HilbertVis,HilbertVisGUI,oneChannelGUI,yeastRNASeq |
| 版本 |
1.6.17 |
| 自 |
Bioconductor 2.3 (r - 2.8) |
包下载
