HTqPCR

高通量qPCR数据的自动化分析

Bioconductor版本:2.6

分析Ct值定量实时PCR (qPCR)化验。在高吞吐量数据可以分析跨多个条件或复制,和spatially-defined格式(ABI TaqMan低密度数组和传统的96或384孔板。HTqPCR处理数据加载、质量评估、标准化、可视化和参数或非参数测试的统计学意义的Ct值之间的特性(如基因、小分子核糖核酸)。

作者:海蒂Dvinge,保罗·伯顿

维护人员:海蒂Dvinge <海蒂在ebi.ac.uk >

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“HTqPCR”)

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文档

PDF	R脚本	qPCR分析R
PDF		参考手册

细节

biocViews	MicrotitrePlateAssay,DifferentialExpression,GeneExpression,DataImport,质量控制,预处理,生物信息学,可视化,MultipleComparisons
取决于	Biobase,RColorBrewer,limma
进口	affy,Biobase,gplots、图形、grDeviceslimma、方法、RColorBrewer统计,跑龙套
建议	statmod
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL	http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
取决于我
进口我
建议我
版本	1.2.0
自	Bioconductor 2.5 (r - 2.10)

包下载

包的来源	HTqPCR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	HTqPCR_1.2.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	HTqPCR_1.2.0.tgz
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