GlobalAncova

计算全球测试组间差异基因表达

Bioconductor版本:2.6

我们给下面的参数支持GlobalAncova方法:适当的正常化后,基因表达数据出现,而对称和离群值没有真正的问题,所以最小二乘应该相当强劲。ANCOVA交互产生饱和数据建模如不同意味着每组和基因。协变量调整可以帮助纠正可能选择偏见。残差方差同质性和不相关的无法预期。普通最小二乘法的应用给予公正的,但不再最优估计(Gauss-Markov-Aitken)。因此,使用经典的野生是不合适的,由于相关性。然而镜子偏离零假设检验统计量。结合一个排列方法,实证意义可以近似水平。另外,一个近似收益率渐近假定值。这项工作是支持的NGFN格兰特01 GR 0459年,德国BMBF。

作者:美国Mansmann, r·迈斯特·m·胡默尔r . Scheufele s Knueppel的贡献

维修工:r·迈斯特在tfh-berlin.de > <迈斯特

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GlobalAncova”)

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文档

PDF	R脚本	GlobalAncova.pdf
PDF	R脚本	GlobalAncovaDecomp.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,生物信息学,DifferentialExpression,通路
取决于	方法,corpcor,globaltest
进口	注释,AnnotationDbi
建议	Biobase,注释,GO.db,KEGG.db,golubEsets,hu6800.db,vsn,GSEABase
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL
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版本	3.16.0
自	Bioconductor 1.7 (r - 2.2)

包下载

包的来源	GlobalAncova_3.16.0.tar.gz
Windows二进制	GlobalAncova_3.16.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GlobalAncova_3.16.0.tgz
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