GeneticsBase

处理遗传数据的类和函数

Bioconductor版本:2.6

R遗传学项目是一项合作努力,旨在开发一套完整的工具,用于存储、访问、操作和分析遗传学数据,从由少数遗传标记组成的小型候选基因研究到包含数十万个标记的大型全基因组研究。这个包(GeneticsBase)提供了高效数据结构和易于使用的操作函数的基础。

作者:Gregory Warnes < Warnes at bst.rochester.edu> Ross Lazarus < Ross。lazarus at chaning.harvard.edu > Scott D Chasalow < Scott。chasalow at bms.com> Giovanni Montana < Giovanni。在bms.com>迈克尔·奥康奈尔 Junsheng Cheng Nitin Jain < Nitin。Jain在pfizer。com>

维护者:R遗传学项目< R - Genetics -talk at lists.sourceforge.net>

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneticsBase”)

要在出版物中引用此包,请输入R并输入:

引用(“GeneticsBase”)

文档

PDF CAMP_alleleSummary_html.pdf
PDF CAMP_genotypeSummary_html.pdf
PDF CAMP_LD_html.pdf
PDF R脚本 装载基因型数据
PDF R脚本 汇总表
PDF R脚本 汇总表
PDF 参考手册

细节

biocViews 遗传学
取决于 R(>= 2.3.1),方法,combinat
进口 gdata(> = tripwire),gplots(> = 2.3.1),gtools(>= 2.2.3),图形,grDevices,方法,统计,utils,xtable
建议 GeneticsDesignfbat
系统需求
许可证 LGPL
URL
全靠我 fbat
进口我 fbat
建议我
版本 1.14.0
Bioconductor 2.0 (R-2.5)

包下载

包的来源 GeneticsBase_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 GeneticsBase_1.14.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 GeneticsBase_1.14.0.tgz
软件包下载报告 下载数据

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