GeneRegionScan

GeneRegionScan

Bioconductor版本:2.6

一个集中于分析基因组离散区域的软件包。这个包对于使用Affymetrix数据调查一个或几个基因非常有用，因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探测级别的数据，并将这些数据包装到ProbeLevelSet中。ProbeLevelSet直接扩展了expressionSet，但是包含了关于每个探测的序列和它派生自的探测集的附加信息。该包包含许多用于绘制这些探针级数据的函数，作为沿着mrna链序列定位的函数。这可以用于变量拼接的分析，特别适合用于外显子阵列数据。

作者:Lasse Folkersen, Diego Diez

维护者:Lasse Folkersen < Lasse。福克森在kiss .se>

要安装这个包，开始R，然后输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)

要在发布中引用此包，请开始R并输入:

引用(“GeneRegionScan”)

文档

PDF	R脚本	GeneRegionScan
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，DataImport，统计数据，单核苷酸多态性，OneChannel，可视化
取决于	方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings
进口	Biobase(> = 2.5.5),affxparser，RColorBrewer，Biostrings
建议	BSgenome，affy，AnnotationDbi
系统需求
许可证	GPL (>= 2)
URL
全靠我
进口我
建议我
版本	1.4.0
自	Bioconductor 2.4 (R-2.9)

包下载

包的来源	GeneRegionScan_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	GeneRegionScan_1.4.0.zip(32- & 64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	GeneRegionScan_1.4.0.tgz
软件包下载报告	下载数据