GOSemSim

语义相似性度量

Bioconductor版本:2.6

分别实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang提出的5种GO语义相似度估计方法。支持许多物种，包括按蚊，拟南芥，牛，犬，鸡，黑猩猩，大肠杆菌菌株K12和菌株酒井，苍蝇，人类，疟疾，小鼠，猪，恒河猴，大鼠，蠕虫，非洲爪蟾，酵母和斑马鱼。

作者:余光创，肖传乐

维护人员:guangchuangyu

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)

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引用(“GOSemSim”)

文档

PDF	R脚本	语义相似性度量
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，聚类，通路
取决于	AnnotationDbi，GO.db，org.Hs.eg.db
进口
建议	org.Ag.eg.db，org.At.tair.db，org.Bt.eg.db，org.Ce.eg.db，org.Cf.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.EcK12.eg.db，org.EcSakai.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Mmu.eg.db，org.Pf.plasmo.db，org.Pt.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Sc.sgd.db，org.Ss.eg.db，org.Xl.eg.db
系统需求
许可证	GPL-2
URL
全靠我
进口我
建议我
版本	1.6.8
自	Bioconductor 2.4 (R-2.9)

包下载

包的来源	GOSemSim_1.6.8.tar.gz
Windows二进制	GOSemSim_1.6.8.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	GOSemSim_1.6.8.tgz
软件包下载报告	下载数据