DESeq

数字基因表达形式分析的基础上,负二项分布

Bioconductor版本:2.6

估计variance-mean依赖在计数高通量测序数据分析和测试基于模型的微分表达式使用负二项分布

作者:西蒙•安德斯EMBL海德堡<桑德斯在fs.tum.de >

维修工:西蒙·安德斯<桑德斯在fs.tum.de >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“DESeq”)

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引用(“DESeq”)

文档

PDF	R脚本	分析RNA-Seq数据与“DESeq”包
PDF		参考手册

细节

biocViews	HighThroughputSequencing,ChIPseq,RNAseq,圣人,DifferentialExpression
取决于	Biobase,locfit
进口	genefilter,geneplotter、方法
建议
系统需求
许可证	GPL (> = 3)
URL	http://www-huber.embl.de/users/anders/DESeq/
取决于我
进口我
建议我
版本	1.0.6
自	Bioconductor 2.6 (r - 2.11)

包下载

包的来源	DESeq_1.0.6.tar.gz
Windows二进制	DESeq_1.0.6.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	DESeq_1.0.6.tgz
包下载报告	下载数据