ChIPsim

模拟ChIP-seq实验

Bioconductor版本:2.6

一个通用的框架,ChIP-seq数据的仿真。虽然目前集中在核小体定位包的目的是支持不同类型的实验。

作者:彼得·汉保格

维护人员:彼得汉保格<彼得。汉保格在well.ox.ac.uk >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChIPsim”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“ChIPsim”)

文档

PDF	R脚本	模拟ChIP-seq实验
PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施,生物信息学,ChIPseq
取决于	Biostrings
进口	IRanges,Biostrings,ShortRead、图形方法,统计,跑龙套
建议	actuar,动物园
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL
取决于我
进口我
建议我
版本	1.2.0
自	Bioconductor 2.5 (r - 2.10)

包下载

包的来源	ChIPsim_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPsim_1.2.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	ChIPsim_1.2.0.tgz
包下载报告	下载数据