CGHnormaliter

正常化全息阵列数据与不平衡的畸变。

Bioconductor版本:2.6

CGHnormaliter是aCGH正常化的迭代算法数据显示不平衡的畸变。首先,有附带条件的平衡复制数字识别和随后用于基于洛斯的正常化。这两个步骤然后迭代完善正常化。这里的假设是,暂时排除畸变允许一个更合适的洛斯回归曲线的计算。因此,归一化后,log2法线的强度比率通常会更接近零,更好地反映生物的现实。

作者:托马斯·w·Binsl汉斯·巴特P.P. van Houte Hettling

维修工:巴特P.P. van Houte < bvhoute在few.vu.nl >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“CGHnormaliter”)

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引用(“CGHnormaliter”)

文档

PDF	R脚本	全息normaliter包
PDF		CGHnormaliter-overview.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,DNACopyNumber,预处理
取决于	CGHcall(> = 2.2.0),CGHbase(> = 1.2.0)
进口	Biobase,CGHbase,CGHcall、方法、统计跑龙套
建议
系统需求
许可证	GPL (> = 3)
URL
取决于我
进口我
建议我
版本	1.2.0
自	Bioconductor 2.5 (r - 2.10)

包下载

包的来源	CGHnormaliter_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	CGHnormaliter_1.2.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	CGHnormaliter_1.2.0.tgz
包下载报告	下载数据