Bioconductor版本:2.6
ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具,用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应,或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),非常通用(可以应用于导致富集区域的实验),并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快,在有足够内存的情况下,可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。
作者:Sean Davis
维护者:Sean Davis
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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“极致”)
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R脚本 | ACME | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学 |
取决于 | Biobase(>= 2.5.5),方法 |
进口 | 图形、统计数据 |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | GPL (>= 2) |
URL | http://watson.nci.nih.gov/~sdavis |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
版本 | 测试盒框 |
自 | Bioconductor 2.0 (R-2.5) |
包的来源 | ACME_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ACME_2.4.0.zip(32位和64位) |
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 | ACME_2.4.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |