################################################### ### 块1号 : ################################################### 图书馆(“biocDatasets ") ################################################### ### 块2号 : ################################################### n_transcripts < - 250成绩单< - randomDNASequences (n_transcripts样本(300:10000 n_transcripts,取代= TRUE )) ################################################### ### 块3号:################################################### n_probes < - 10 len_probe < - 25红外< -向量(“列表”,长度= n_transcripts) < - data.frame特性(seq =我(代表(“”,n_transcripts * n_probes)),目标=代表(as.integer (NA), n_transcripts * n_probes)),(我在1:n_transcripts) {s < -记录[[我]]红外[[我]]< - randomIRanges (n_probes len_probe 1,长度(s),取代= FALSE)特性美元seq [(1: n_probes) +(张)* n_probes] < -。字符(msubseq(年代,红外[[我]]))功能目标美元[(1:n_probes) +(张)* n_probes) <——我 } ################################################### ### 块4号 : ################################################### 总结(复制(seq美元特性 )) ################################################### ### 块5号 : ################################################### ppo < - createProbeCoords (50, 50 ) ################################################### ### 块6号:################################################### 情节(ppo $ x, ppo $ y, pch =".") ################################################### ### 块7号 : ################################################### scramble_i < -样本(seq (= ppo $ x)) array_layout < - cbind(特性,ppo [scramble_i,]) row.names (array_layout) < - seq (= array_layout [[1 ]]) ################################################### ### 块8号:################################################### x < - expression_arraywide (50 * 50 ) ################################################### ### 块9号 : ################################################### x2 < - replicate_arraywide (x ) ################################################### ### 块10号:################################################### m < - cbind (x, x2) colnames (m) < - c(1、2)rownames (m) < - seq(1、50 * 50 ) ################################################### ### 块11号 : ################################################### 库(Biobase) eset < -新(“ExpressionSet featureData = new(“AnnotatedDataFrame”,array_layout) exprs = m ) ################################################### ### 块12号:eset2dataframe ################################################### eset2dataframe < -函数(eset) {pdataf < - pData (eset) dataf < -拉普(pdataf,函数(col)代表(坳,代表(nrow (exprs (eset)), nrow (pdataf)))) dataf < - as.data.frame (dataf) dataf < - cbind (exprs = c (exprs (eset)),数组=代表(rownames (pdataf),每个= nrow (exprs (eset))), dataf)返回(dataf ) } ################################################### ### 块13号:################################################### sample_a_seed < - expression_arraywide (50 * 50) sample_b_seed < - expression_arraywide (50 * 50 ) ################################################### ### 块14号:################################################### m < -向量(“列表”,长度= 6)(我在1:3){m[[我]]< - replicate_arraywide (sample_a_seed) m [[i + 3]] < - replicate_arraywide (sample_b_seed)} m < -矩阵(unlist (m), ncol = 6) sample_data < - data.frame (grp =代表(c (a, b), c(3、3)))rownames (sample_data) < - 1:6 ################################################### ### 块数量15:################################################### eset < -新(“ExpressionSet featureData = new(“AnnotatedDataFrame”,array_layout) exprs = m, phenoData = new(“AnnotatedDataFrame”,sample_data )) ################################################### ### 块16号 : ################################################### dataf < - eset2dataframe (eset)库(晶格)p < - densityplot (~ exprs | grp组= dataf数组,美元数据= dataf pch =“。”)打印(p)