topgo
Topgo：基因本体论的富集分析
生物导体版本：2.5
Topgo软件包提供了用于测试GO术语的工具，同时考虑GO图的拓扑结构。可以实施和应用不同的测试统计数据和不同的方法来消除GO术语之间的局部相似性和依赖性。
作者：Adrian Alexa，Jorg Rahnenfuhrer
维护者：Adrian Alexa
要安装此软件包，请启动R并输入：
来源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ topgo”）
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引用（“ Topgo”）
文档
| R脚本 | topgo | |
| topgo_classes_v3.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，生物信息学，，，，可视化 |
| 要看 | R（> = 2.10.0），方法，图形（> = 1.14.0），生物酶（> = 2.0.0），go.db（> = 2.3.0），AnnotationDbi（> = 1.7.19），Sparsem（> = 0.73） |
| 进口 | 方法，图形，，，，生物酶，，，，Sparsem，，，，AnnotationDbi，，，，格子 |
| 建议 | 全部，，，，HGU95AV2.DB，，，，HGU133A.DB，，，，GeneFilter，，，，Xtable，，，，多检验，，，，rgraphviz，，，，全球测试 |
| 系统要求 | |
| 执照 | LGPL |
| URL | |
| 取决于我 | rnaither |
| 进口我 | |
| 建议我 | 林戈 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 自从 | 生物导体2.0（R-2.5） |
软件包下载
| 包源 | topgo_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | topgo_1.14.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.5（豹）二进制 | topgo_1.14.0.tgz |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
