pdInfoBuilder

平台设计信息包构建器

生物导体版本:2.5

构建平台设计信息包。这些由包含特征级数据的SQLite数据库组成,如x、y在芯片上的位置和featureSet ID。数据库还包含了feature set级别的注释数据。该包装产品用于低聚pkg。

作者:Seth Falcon, Benilton Carvalho,由Vince Carey和Matt Settles贡献

维护者:Benilton Carvalho

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pdInfoBuilder”)

要在出版物中引用此包,请输入R并输入:

引用(“pdInfoBuilder”)

文档

PDF R脚本 使用pdInfoBuilder构建注释包,用于oligo包
PDF R脚本 PDInfo封装构建Affymetrix映射芯片
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释基础设施
取决于 R(>= 2.10.0),方法,Biobase(> = 2.5.5),RSQLite(> = 0.7 1),affxparser(> = 1.7.3),益生元(> = 1.9.19)
进口 Biostrings(> = 2.13.50),IRanges(> = 1.3.89)
建议
系统需求
许可证 艺术- 2.0
URL
全靠我
进口我
建议我
版本 1.10.1
Bioconductor 2.0 (R-2.5)

包下载

包的来源 pdInfoBuilder_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 pdInfoBuilder_1.10.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 pdInfoBuilder_1.10.1.tgz
软件包下载报告 下载数据

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弗雷德哈钦森癌症研究中心