panp

从负链匹配Probesets Presence-Absence调用

Bioconductor版本:2.5

使基因的存在/没有调用函数基于距离负链匹配probesets (NSMP)来自Affymetrix注释。PANP应用创建后基因表达值,因此可以使用任何预处理方法如MAS5或GCRMA之后,或者像RMA PM-only方法。HGU133A NSMP集已建立,hgu133 - + - 2.0芯片组。

作者:彼得·沃伦

维护人员:华伦<彼得。沃伦在verizon.net >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (panp)

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引用(panp)

文档

PDF	R脚本	基因存在/没有电话
PDF		参考手册

细节

biocViews
取决于	R (> = 2.5.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5)
进口
建议
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL
取决于我
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版本	1.16.0
自	Bioconductor 1.8 (r - 2.3)

包下载

包的来源	panp_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	panp_1.16.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	panp_1.16.0.tgz
包下载报告	下载数据