marray

探索性分析可以发现微阵列数据

Bioconductor版本:2.5

类定义为双色发现微阵列数据。数据输入功能,诊断情节、标准化和质量检查。

作者:绮华(Jean)杨在maths.usyd.edu.au > < jeany Agnes Paquet和Sandrine Dudoit。

杨维护者:绮华(Jean) <珍biostat.ucsf.edu >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“marray”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“marray”)

文档

PDF ExampleHTML.pdf
PDF R脚本 marray正常化
PDF R脚本 marray概述
PDF R脚本 marrayClasses概述
PDF R脚本 marrayClasses教程(短)
PDF R脚本 marrayInput介绍
PDF R脚本 marrayPlots概述
PDF widget1.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,TwoChannel,预处理
取决于 R (> = 1.9.0),limma、方法
进口
建议 tkWidgets
系统需求
许可证 LGPL
URL http://www.maths.usyd.edu.au/u/jeany/
取决于我 arrayQuality,beta7,CGHbase,转换,dyebias,dyebiasexamples,GeneTraffic,maigesPack,nnNorm,奥林,RMAGEML,stepNorm
进口我 arrayQualityMetrics
建议我 Agi4x44PreProcess,AgiMicroRna,hexbin,limma,Mfuzz
版本 1.24.0
Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早

包下载

包的来源 marray_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 marray_1.24.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 marray_1.24.0.tgz
包下载报告 下载数据

工作流»

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