globaltest

协变量的测试组/特性与响应变量,应用基因测试

Bioconductor版本:2.5

全球协变量的测试测试组(或特性)与响应变量。这个包实现了测试与诊断的情节和多个测试工具,连同几个函数方便使用这个测试基因集的测试和KEGG术语。

作者:Jelle Goeman < j。在lumc.nl goeman >and Jan Oosting

维护人员:Jelle Goeman < j。在lumc.nl goeman >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“globaltest”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“globaltest”)

文档

PDF R脚本 全球测试
PDF R脚本 全球测试(弃用版本4)
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,生物信息学,DifferentialExpression,,通路
取决于 方法
进口 Biobase(> = 2.5.5),生存,AnnotationDbi,注释,、图形
建议 vsn,golubEsets,KEGG.db,hu6800.db,Rgraphviz,GO.db,lungExpression,org.Hs.eg.db,注释,Biobase(> = 2.5.5),生存,GSEABase
系统需求
许可证 GPL (> = 2)
URL http://www.msbi.nl/goeman
取决于我 GlobalAncova
进口我 SIM卡
建议我 topGO
版本 正式
Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早

包下载

包的来源 globaltest_5.0.2.tar.gz
Windows二进制 globaltest_5.0.2.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 globaltest_5.0.2.tgz
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