chipseq

chipseq:用于分析chipseq数据的包

生物导体版本:2.5

帮助处理chipseq实验的短读取数据的工具

作者:Deepayan Sarkar, Robert Gentleman, Michael Lawrence，姚紫珍

维护者:Biocore Team c/o BioC用户列表

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chipseq”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“chipseq”)

文档

PDF	R脚本	一个样本ChIP-Seq分析工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施，生物信息学
取决于	方法,IRanges(> = 1.3.77),BSgenome，ShortRead，晶格
进口	BSgenome，IRanges，晶格、方法、ShortRead,统计数据
建议	GenomicFeatures，GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9，GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
全靠我
进口我
建议我
版本	0.2.1
自	生物导体2.5 (R-2.10)

包下载

包的来源	chipseq_0.2.1.tar.gz
Windows二进制	chipseq_0.2.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	chipseq_0.2.1.tgz
软件包下载报告	下载数据