Biomart

BiomArt数据库的接口(例如Ensembl,Wormbase和Gramene)

生物导体版本:2.5

近年来,公共数据存储库已获得大量生物学数据。对于全面的生物信息学数据分析,需要轻松访问这些有价值的数据资源和与数据分析的公司集成。BIOMART提供了越来越多的数据库集合的接口,该数据库实施了Biomart软件套件(http://www.biomart.org)。该软件包可以以统一的方式检索大量数据,而无需了解基础数据库模式或编写复杂的SQL查询。Biomart数据库的示例是Ensembl,Uniprot,Gramene,Wormbase和Hapmap。这些主要数据库使BiomArt用户可以直接访问各种数据集,并启用从基因注释到数据库挖掘的广泛强大的在线查询。

作者:Steffen Durinck ,Wolfgang Huber ,Sean Davis

维护者:Steffen durinck

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引用(“ Biomart”)

文档

PDF R脚本 BIOMART用户指南
PDF 参考手册

细节

生物浏览 注解
要看 方法
进口 XML,,,,rcurl
建议 注释
系统要求
执照 艺术2.0
URL
取决于我 Chippeakanno,,,,域名,,,,Gene2Pathway,,,,基因组
进口我 Affycoretools,,,,Chippeakanno,,,,rnaither
建议我 生物探测,,,,CCTORIAL,,,,Geneanswers,,,,Genominator,,,,MADB,,,,Onechannelgui,,,,Shortread,,,,SIM
版本 2.2.0
自从 生物导体1.6(R-2.1)或更早

软件包下载

包源 biomart_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 biomart_2.2.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 biomart_2.2.0.tgz
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