beadarray

Illumina BeadArray数据的质量评估和底层分析

生物导体版本:2.5

该包能够读取由BeadScan输出的串珠级数据(原始tiff和文本文件)以及来自BeadStudio的串珠摘要数据。提供了质量评价和低层次分析的方法。

作者:马克·邓宁，迈克·史密斯，乔纳森·凯恩斯，安迪·林奇，马特·里奇

维护者:Mark Dunning

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“beadarray”)

文档

PDF		BASH.pdf
PDF	R脚本	beadarray.pdf
PDF		beadlevel.pdf
PDF		beadsummary.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，质量控制，预处理
取决于	Biobase(>= 2.5.5)，方法
进口	hwriter，limma
建议	光民，vsn，affy
系统需求
许可证	GPL
URL
全靠我
进口我	arrayQualityMetrics
建议我	beadarraySNP，光民
版本	1.14.0
自	Bioconductor 1.8 (R-2.3)

包下载

包的来源	beadarray_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	beadarray_1.14.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	beadarray_1.14.0.tgz
软件包下载报告	下载数据