RpsiXML

R接口到PSI-MI 2.5文件

Bioconductor版本:2.5

交互数据集可视化的查询、数据结构和接口。该软件包实现了PSI-MI 2.5标准,目前支持8个数据库。进一步支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断添加。

作者:张继涛,Stefan Wiemann, Marc Carlson, Tony Chiang贡献

维护人员:jiao David Zhang

要安装这个包,开始R,然后输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)

要在发布中引用此包,请开始R并输入:

引用(“RpsiXML”)

文档

PDF R脚本 RpsiXML包的应用示例
PDF R脚本 读取PSI-25 XML文件
PDF 参考手册

细节

biocViews 基础设施,蛋白质组学
取决于 方法,注释(> = 1.21.0),(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
建议 org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats
系统需求
许可证 LGPL-3
URL //www.anjoumacpherson.com
全靠我 ScISI
进口我 ScISI
建议我
版本 1.6.0
生物导体2.3 (R-2.8)

包下载

包的来源 RpsiXML_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 RpsiXML_1.6.0.zip(32- & 64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件 RpsiXML_1.6.0.tgz
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