林戈

R调查芯片芯片寡聚架

生物导体版本:2.5

包装铃声促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是数据读数,质量评估,数据可视化和基因组区域的识别,显示了CHIP-CHIP中的富集。该软件包具有处理芯片芯片项目中使用的Nimblegen的两色寡核苷酸微阵列的功能,但鉴于数据以RGLIST(RGLIST(RAW)或expressionset(pre-pre-pre-predionset)提供(pre-pre-prectionset)(pre-chip-chip数据分析)(pre-chip-chip数据分析)(处理)。该软件包采用了来自生物导体项目的其他各种软件包的功能,并提供了其他芯片芯片特异性和敏捷特异性功能。

作者:Joern Toedling,Oleg Sklyar,Tammo Krueger,Matt Ritchie,Wolfgang Huber

维护者:J。Toedling

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来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ringo”)

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引用(“林戈”)

文档

PDF R脚本 r对敏捷寡聚的调查
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,两通道,,,,DataImport,,,,QualityControl,,,,预处理
要看 方法,生物酶(> = 1.14.1),rcolorbrewer,,,,林玛,,,,矩阵, 网格
进口 GeneFilter,,,,林玛,,,,VSN
建议 rtracklayer(> = 1.3.1),mclust,,,,topgo(> = 1.13.1)
系统要求
执照 艺术2.0
URL
取决于我 斯塔尔
进口我
建议我
版本 1.10.0
自从 生物导体2.0(R-2.5)

软件包下载

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