Generegionscan

Generegionscan

生物导体版本:2.5

专注于分析基因组离散区域的软件包。该软件包对于使用Affymetrix数据研究一个或几个基因很有用,因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级别数据,并将这些数据包装到ProbelevelSet中。probelevelset直接扩展了extressionset,但包括有关每个探针序列及其衍生的探针集的其他信息。该软件包包括许多用于绘制这些探针级别数据作为沿mRNA链序列的位置的函数的功能。这可用于分析可变剪接,并且特别适合与外显子数据数据一起使用。

作者:Lasse Folkersen,迭戈·迪兹

维护者:lasse folkersen

要安装此软件包,请启动R并输入:

来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genereGionscan”)

要在出版物中引用此软件包,请启动R并输入:

引用(“ generegionscan”)

文档

PDF R脚本 Generegionscan
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,DataImport,,,,统计数据,,,,SNP,,,,Onechannel,,,,可视化
要看 方法,生物酶(> = 2.5.5),生物弦
进口 生物酶(> = 2.5.5),affxparser,,,,rcolorbrewer,,,,生物弦
建议 BSGENOME,,,,副词,,,,AnnotationDbi
系统要求
执照 GPL(> = 2)
URL
取决于我
进口我
建议我
版本 1.2.0
自从 生物导体2.4(R-2.9)

软件包下载

包源 generegionscan_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 generegionscan_1.2.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 generegionscan_1.2.0.tgz
软件包下载报告 下载统计

工作流程»

常见的生物导体工作流程包括:

邮件列表»

向我们的邮件列表发布有关生物处理程序包的问题。阅读发布指南发布之前!

弗雷德·哈钦森癌症研究中心