GGtools

软件和数据起源的基因组学(c) 2006 VJ凯莉

Bioconductor版本:2.5

人类基因组单体型图SNP处理报告,GWAS等等。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)

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引用(“GGtools”)

文档

PDF	R脚本	GGtools Bioinfo应用注释的支持
PDF	R脚本	GGtools概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	单核苷酸多态性,GeneticVariability,遗传学,生物信息学
取决于	R(> = 2.7.0)、方法Biobase(> = 1.11.26),GGBase(> = 3.2.17),GSEABasesnpMatrix (> = 1.7.3),RColorBrewer,RSQLite,Biostrings,rpart
进口	AnnotationDbi,IRanges(> = 1.1.6),annaffy
建议	illuminaHumanv1.db,org.Hs.eg.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20071016,mapLD,haplo.stats
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
取决于我	encoDnaseI
进口我
建议我	GGBase,hmyriB36,ind1KG
版本	3.4.0
自	Bioconductor 1.9 (r - 2.4)

包下载

包的来源	GGtools_3.4.0.tar.gz
Windows二进制	GGtools_3.4.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GGtools_3.4.0.tgz
包下载报告	下载数据