GGBase

基础设施的遗传学基因表达(c) 2008 VJ凯莉

Bioconductor版本:2.5

基础设施来处理人类基因组单体型图SNP报道,GWAS等等。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGBase”)

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引用(“GGBase”)

文档

PDF	R脚本	GGBase概述
PDF	R脚本	smlSet建设概述
PDF	R脚本	snp位置元数据概览
PDF		参考手册

细节

biocViews	单核苷酸多态性,GeneticVariability,遗传学,生物信息学
取决于	R(> = 2.7.0)、方法Biobase(> = 2.5.5),GSEABasesnpMatrix (> = 1.7.6),RSQLite
进口	AnnotationDbi
建议	GGtools,illuminaHumanv1.db
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
取决于我	encoDnaseI,GGdata,GGtools
进口我
建议我	ind1KG
版本	3.6.0
自	Bioconductor 2.2 (r - 2.7)

包下载

包的来源	GGBase_3.6.0.tar.gz
Windows二进制	GGBase_3.6.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GGBase_3.6.0.tgz
包下载报告	下载数据