GEOquery

从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据

Bioconductor版本:2.5

NCBI基因表达综合(GEO)是一个公共存储库的微阵列数据。鉴于该资源丰富多变的本性,它只是自然要BioConductor工具应用到这些数据。GEOquery是地理和BioConductor之间的桥梁。

作者:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

维护人员:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GEOquery”)

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引用(“GEOquery”)

文档

PDF	R脚本	GEOquery.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,DataImport,OneChannel,TwoChannel,圣人
取决于	方法,Biobase,RCurl
进口
建议	limma,RUnit
系统需求
许可证	GPL-2
URL	http://watson.nci.nih.gov/ sdavis
取决于我	dyebiasexamples,GEOmetadb
进口我
建议我	dyebias,PGSEA
版本	14
自	Bioconductor 1.8 (r - 2.3)

包下载

包的来源	GEOquery_2.11.3.tar.gz
Windows二进制	GEOquery_2.11.3.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GEOquery_2.11.3.tgz
包下载报告	下载数据