生物导体版本:2.5
内存有效的字符串容器,匹配算法和其他实用程序的字符串容器,用于快速操纵大型生物序列或一组序列。
作者:H。Pages,P。Aboyoun,R。Gentleman和S. Debroy
维护者:H。页面
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来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ BioStrings”)
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引用(“生物弦”)
R脚本 | 对生物弦中定义的基本类别的简短介绍2 | |
R脚本 | 使用生物弦和BSGENOME数据包进行有效的基因组搜索 | |
R脚本 | 处理探针序列信息 | |
R脚本 | 成对序列比对 | |
R脚本 | 关于DNASTRING()构造函数的矢量化功能的一些旧说明。不适合最终用户。 | |
参考手册 |
生物浏览 | 测序,,,,遗传学,,,,基础设施 |
要看 | R(> = 2.8.0),方法,iranges(> = 1.4.8) |
进口 | 图形,方法,统计,utils,iranges,,,,生物酶 |
建议 | BSGENOME(> = 1.13.14),bsgenome.celegans.ucsc.ce2(> = 1.3.11),bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3(> = 1.3.11),果蝇2企业,,,,HGU95AV2Probe,,,,GenomicFeatures(> = 0.1.3),HGU95AV2CDF,,,,副词,,,,Affydata(> = 1.11.5),运行 |
系统要求 | |
执照 | 艺术2.0 |
URL | |
取决于我 | altcdfenvs,,,,BSGENOME,,,,Chippeakanno,,,,芯片,,,,Generegionscan,,,,ggtools,,,,港口,,,,火柴盒,,,,microRNA,,,,Shortread |
进口我 | AffyCompatible,,,,Bcrank,,,,生物数据集,,,,BioseqClass,,,,Chippeakanno,,,,chipseqr,,,,芯片,,,,GCRMA,,,,Generegionscan,,,,GenomicFeatures,,,,Medme,,,,寡群,,,,pdinfobuilder,,,,劳力士,,,,rtracklayer,,,,Shortread |
建议我 | 注释,,,,Onechannelgui,,,,Slgi,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506 |
版本 | 2.14.12 |
自从 | 生物导体1.6(R-2.1)或更早 |
包源 | BioStrings_2.14.12.tar.gz |
Windows二进制 | BioStrings_2.14.12.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | BioStrings_2.14.12.tgz |
软件包下载报告 | 下载统计 |