ArrayExpress

在EBI访问ArrayExpress Microarray数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

生物导体版本:2.5

访问EBI的ArrayExpress存储库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

作者:奥黛丽·考夫曼

维护者:Audrey Kauffmann < Audrey at ebi.ac.uk>

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayExpress”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“ArrayExpress”)

文档

PDF	R脚本	ArrayExpress:将ArrayExpress数据集导入并转换为R对象
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，DataImport，OneChannel，TwoChannel
取决于	R (>= 2.9.0)，Biobase(> =测试盒框)
进口	XML，affy，limma
建议
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
全靠我
进口我
建议我
版本	1.6.2
自	Bioconductor 2.3 (R-2.8)

包下载

包的来源	ArrayExpress_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	ArrayExpress_1.6.2.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	ArrayExpress_1.6.2.tgz
软件包下载报告	下载数据