################################################### ### 块1号:loadAndListPackages ################################################### 库(hom.Hs.inp.db) ls(“包:hom.Hs.inp.db ") ################################################### ### 块2号:listMapping ################################################### as.list (hom.Hs.inpMUSMU) [1:4 ] ################################################### ### 块3号:mapGeneExample ################################################### #加载人类文库的生物注释数据(org.Hs.eg.db) #获取entrex基因ID的基因符号“MSX2”mget(“MSX2”,org.Hs.egSYMBOL2EG) #获取entrez基因ID的集合蛋白ID“4488”mget(“4488”,org.Hs.egENSEMBLPROT) #使用inparanoid包获取小鼠基因,被认为是#等效于集合蛋白ID“ENSP00000239243”mget(“ENSP00000239243”,home . hm . inpmusmu) #加载鼠标库的生物注释数据(org.Mm.eg.db) #获取Jackson实验室ID“MGI:97169”mget(“MGI:97169”,org.Mm.egMGI2EG) #最后从鼠标mget(“17702”,org.Mm.egSYMBOL) ################################################### ###块号4:seedPairExample ################################################### hom.Hs.inpMUSMU mget(“ENSP00000301011” ) ################################################### ### 块5号:seedPairExample2 ################################################### # 连接到人类数据库mycon < - hom.Hs.inp_dbconn() #列出所有可用的表的DB dbListTables (mycon) #列出表中的列的感兴趣的dbListFields (mus_musculus mycon。 ") ################################################### ### 块6号:seedPairExample3 ################################################### # 做一个查询,让我们看看哪些clust_id我们需要sql < -“SELECT *从mus_musculus inp_id =“ENSP00000301011”;“#检索数据dataOut < - dbGetQuery dataOut (mycon、sql) ################################################### ### 块7号:seedPairExample4 ################################################### # 做一个查询,让我们看到所有的数据是隶属于clust id sql < -“SELECT *从mus_musculus clust_id =“1731”;“#检索数据dataOut < - dbGetQuery dataOut (mycon、sql) ################################################### ### 块8号 : ################################################### toLatex (sessionInfo ())