xps
非对称寡核苷酸阵列包括外显子阵列，全基因组阵列和平板阵列的处理和分析
该软件包处理Affymetrix GeneChip表达阵列的预处理，归一化，过滤和分析，包括外显子阵列(外显子1.0 ST:核心，扩展，全探针)，基因阵列(gene 1.0 ST)和只有1gb RAM的计算机上的平板阵列。它导入Affymetrix . cdf， . clf， . pgf和. cel以及注释文件，并计算例如RMA, MAS5, FARMS, DFW, MAS5-calls, DABG-calls, I/NI-calls。它是一个R包装到XPS(表达式分析系统)，这是基于ROOT，一个面向对象的框架在CERN开发。因此，优先安装ROOT是使用此包的先决条件，但是，不需要了解ROOT。ROOT是在LGPL下授权的，可以从http://root.cern.ch下载。
| 作者 |
Christian Stratowa，维也纳，奥地利 |
| 维护人员 |
基督教Stratowa |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite (xps)
文档
细节
| biocViews |
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| 取决于 |
R、方法 |
| 进口 |
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| 建议 |
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| 系统需求 |
root_v5.22.00 < http://root.cern。ch> -请参阅README文件的安装说明。 |
| 许可证 |
GPL (>= 2.0) |
| URL |
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| 全靠我 |
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| 进口我 |
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| 建议我 |
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| 发展历史 |
Bioconductor更新日志 |
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