tilingArray

高密度寡核苷酸平铺阵列的转录本作图

该软件包提供的功能可用于分析高密度平片微阵列数据(如来自Affymetrix基因芯片),以测量转录本丰度和结构。该软件包的主要功能有:1。类'segmentation'用于表示线性序列数据的分割;2.函数“分段”拟合分段常数模型使用的动态规划算法,既快又准确;3.函数'confint'用于使用结构包计算置信区间;4.函数'plotAlongChrom'用于生成漂亮的图形;5. the function 'normalizeByReference' for probe-sequence dependent response adjustment from a (set of) reference hybridizations.

作者 沃尔夫冈·胡贝尔,徐振宇,约恩·托德林,马特·里奇撰稿
维护人员 (徐

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tilingArray”)

文档

使用tilingArray包中的normalizeByReference函数进行规范化 PDF R脚本
补充。成本矩阵的计算 PDF R脚本
介绍使用分段函数拟合分段常数曲线 PDF R脚本
分割演示 PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
Biobase,方法,像素图
进口
strucchange,affyvsngenefilter, RColorBrewer,网格
建议
系统需求
许可证 艺术许可,2.0版
URL
全靠我
进口我
建议我
发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 tilingArray_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 tilingArray_1.22.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 tilingArray_1.22.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 tilingArray_1.22.0.tgz
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