该软件包提供的功能可用于分析高密度平片微阵列数据(如来自Affymetrix基因芯片),以测量转录本丰度和结构。该软件包的主要功能有:1。类'segmentation'用于表示线性序列数据的分割;2.函数“分段”拟合分段常数模型使用的动态规划算法,既快又准确;3.函数'confint'用于使用结构包计算置信区间;4.函数'plotAlongChrom'用于生成漂亮的图形;5. the function 'normalizeByReference' for probe-sequence dependent response adjustment from a (set of) reference hybridizations.
作者 | 沃尔夫冈·胡贝尔,徐振宇,约恩·托德林,马特·里奇撰稿 |
维护人员 | (徐 |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tilingArray”)
使用tilingArray包中的normalizeByReference函数进行规范化 | R脚本 | |
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补充。成本矩阵的计算 | R脚本 | |
介绍使用分段函数拟合分段常数曲线 | R脚本 | |
分割演示 | R脚本 | |
参考手册 |
biocViews | |
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取决于 |
Biobase,方法,像素图 |
进口 | |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | 艺术许可,2.0版 |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | tilingArray_1.22.0.tar.gz |
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Windows二进制 | tilingArray_1.22.0.zip |
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | tilingArray_1.22.0.tgz |
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | tilingArray_1.22.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |