该包是包MAT的R版本，包含函数来解析和合并Affymetrix BPMAP和CEL平铺数组文件(使用基于c++的Fusion SDK和Bioconductor包affxparser)，使用特定序列模型规范化平铺数组，从ChIP-chip实验中检测富集区域。注意:用户应安装GSL和f GenomeGraphs。Windows用户:“参考源发行版的inst目录中可用的README文件以获得必要的配置说明”。
| 作者 | Charles张，Arnaud Droit和Raphael Gottardo |
| 维护人员 | Arnaud Droit和Raphael Gottardo |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rMAT”)
| rat用户指南 | R脚本 | |
|---|---|---|
| 参考手册 |
| biocViews | |
|---|---|
| 取决于 | |
| 进口 | |
| 建议 | |
| 系统需求 | |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| URL | http://www.rglab.org |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 发展历史 | Bioconductor更新日志 |
| 包的来源 | rMAT_1.1.2.tar.gz |
|---|---|
| Windows二进制 | rMAT_1.1.2.zip |
| MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | rMAT_1.1.2.tgz |
| MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | rMAT_1.1.2.tgz |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |