gene2pathway

预测KEGG通路成员基于InterPro域的单个基因签名

包需要一系列基因和KEGG路径映射到每个基因预测。这是通过观察每个基因的InterPro域。分配给每个预测一个信心得分。包还允许预测连接组件内部成员的基因信号通路。单独的模型为每个支持的生物KEGG可以训练。

作者	蒂姆•Beissbarth Holger Froehlich,贡献
维护人员	Holger Froehlich

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“gene2pathway”)

gene2pathway	PDF	R脚本
参考手册

biocViews	微阵列,生物信息学,分类,GraphsAndNetworks,通路
取决于	R, kernlab,KEGG.db,biomaRt,KEGGSOAP,RBGL,AnnotationDbi,org.Dm.eg.db
进口	SSOAP,RCurl
建议
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL
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发展历史	Bioconductor更新日志