林格

R调查ChIP-chip Oligoarrays

包林格推动ChIP-chip的主要分析数据。包装的主要功能是数据写入、质量评估、数据可视化和识别基因组区域显示ChIP-chip浓缩。包从罗氏函数处理双色寡核苷酸微阵列用于ChIP-chip项目,但也包含了更一般的函数ChIP-chip数据分析,考虑到数据提供RGList(生)或ExpressionSet(前处理)。的包使用函数从各种其他包Bioconductor项目和提供了额外的ChIP-chip-specific和NimbleGen-specific功能。

作者 Joern Toedling,奥列格•Sklyar Tammo克鲁格,沃尔夫冈·胡贝尔马特•里奇
维护人员 j . Toedling

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“林格”)

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罗氏Oligoarrays R调查 PDF R脚本
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细节

biocViews
取决于
方法,BiobaseRColorBrewer,limma,矩阵
进口
建议
rtracklayer,mclust
系统需求
许可证 艺术授权2.0
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发展历史 Bioconductor更新日志

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包的来源 Ringo_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 Ringo_1.8.0.zip
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MacOS X 10.5(豹)二进制 Ringo_1.8.0.tgz
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