包 |
维护人员 |
标题 |
AffyExpress |
Xuejun阿瑟·李 |
Affymetrix质量评估和分析工具 |
apComplex |
丹尼斯Scholtens |
估计蛋白质复杂的会员使用AP-MS数据 |
arrayQuality |
艾格尼丝Paquet |
数组质量评估发现数组 |
ArrayTools |
亚瑟•李 |
geneChip分析包 |
BioMVCClass |
伊丽莎白·惠伦 |
模型-视图-控制器(MVC)使用Biobase的类 |
cellHTS |
Ligia胸罩 |
分析基于单元的屏幕 |
cellHTS2 |
Florian Hahne |
分析细胞屏幕- cellHTS的修订版本 |
CGHcall |
会发生Vosse |
畸变呼吁全息阵列肿瘤概要文件。 |
CGHregions |
会发生Vosse |
全息阵列数据的降维以最少的信息丢失。 |
国王杯 |
詹姆斯·w·麦克唐纳 |
函数来执行癌症离群值剖面分析。 |
ctc |
安东尼·卢卡斯 |
集群和树转换。 |
EBImage |
格雷戈勒加索尔 |
图像处理工具箱为R |
ecolitk |
劳伦特 |
元数据和工具为大肠杆菌 |
exonmap |
Crispin米勒 |
高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据 |
explorase |
迈克尔•劳伦斯 |
探索性数据分析的GUI系统生物学数据 |
flowClust |
拉斐尔Gottardo |
集群的流式细胞术 |
flowViz |
Florian Hahne |
可视化的流式细胞术 |
群 |
丹特南鲍姆 |
广播数据之间R和其他生物信息学计划 |
geneplotter |
Biocore团队c / o BioC用户列表 |
图形为Bioconductor相关功能 |
GeneRegionScan |
Lasse Folkersen |
GeneRegionScan |
GenomeGraphs |
史蒂芬Durinck |
从运用绘制基因组信息 |
goTools |
艾格尼丝Paquet |
功能基因本体数据库 |
Heatplus |
亚历山大plone ( |
一个热图显示协变量和着色集群 |
帮助 |
里德·汤普森 |
帮助数据分析的工具 |
hexbin |
尼古拉斯Lewin-Koh |
六角面元的例程 |
HilbertVis |
西蒙•安德斯 |
希尔伯特曲线的可视化 |
HilbertVisGUI |
西蒙•安德斯 |
HilbertVisGUI |
染色体组型 |
卡尔·j·Dykema |
染色体组型 |
KCsmart |
约玛•德过来 |
多样品aCGH使用内核卷积分析包 |
macat |
Joern Toedling |
微阵列染色体分析工具 |
maCorrPlot |
亚历山大plone ( |
在微阵列数据可视化人工相关性 |
时间的 |
约翰内斯Rainer |
芯片微阵列数据分析的数据库和效用函数。 |
MergeMaid |
于宁波钟 |
合并女仆 |
Mfuzz |
马提亚Futschik |
软聚类时间序列基因表达数据 |
MVCClass |
伊丽莎白·惠伦 |
模型-视图-控制器(MVC)类 |
奥林 |
马提亚Futschik |
优化的本地intensity-dependent正常化双色微阵列 |
OLINgui |
马提亚Futschik |
奥林的图形用户界面 |
普拉达 |
Florian Hahne |
数据分析对细胞功能检测 |
quantsmooth |
1月东 |
分位数平滑和基因组数组数据的可视化 |
犹太人的尊称 |
卡尔·j·Dykema |
区域表达偏见 |
RNAither |
诺拉Rieber |
统计分析的高通量RNAi屏幕 |
rtracklayer |
迈克尔•劳伦斯 |
R接口基因组浏览器及其注释 |
SIM卡 |
范Iterson |
综合分析基因表达和copynumber数据 |
simpleaffy |
Crispin米勒 |
非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
SNPchip |
罗伯特Scharpf |
类和方法对高吞吐量SNP芯片数据 |
tilingArray |
(徐 |
记录映射与高密度寡核苷酸花砖数组 |
topGO |
Adrian Alexa |
topGO:浓缩分析基因本体 |
VanillaICE |
罗伯特Scharpf |
高通量基因序列的隐马尔可夫模型 |
xmapbridge |
蒂姆·耶茨 |
策划文件导出到xmapBridge X:可视化的地图 |